番石榴是高度易腐的水果，极不耐贮藏，在常温下放置1-2天就失去新鲜的风味和降低维生素C含量。因此。应尽量缩短果实贮藏时间，减少腐败、过熟、虫咬或受伤的果实，然后用加有清洗剂（如钠-2-乙基已烷磺酸盐）的水进行清洗，再用清水流洗干净沥干。沥干后分级冷藏，以8-10℃相对湿度85-90%的环境较合适，可贮藏15－30天。冷藏前要进行适当包装，包装容器多用80－90cm高的竹箩，每箩约装20－25kg。箩的四周可用树叶垫放，以免压伤果皮，果实分层排放，果微带倾斜，萼部向上放置，以免萼片刺伤上层果，上盖一层嫩枝叶后加上盖绑好，即可进入冷库或冷藏车中运往销售地。
表1 采摘后从番石榴中分离出来的真菌、细菌和害虫
病 原 　　　　　病 症
真菌
Aspergillus niger 　　　软腐烂
Botryodiplodia theobromae 　　　　　果柄部腐烂
Botryos phaeria bezengria 　　　　　　　　　　　受伤果实上出现褐色腐烂
（f．P．Dothio rella gregaria）
Choanephora cucurbita cearum 　　　软腐烂
Colletotrichum gloeoporiodes
Corticium rolfisii 　　　炭疽病
Cur vularia tuberculata 　　　微红斑点
　　 　　　　　　　　　受伤果实上褐色腐烂
Cylindrocladium scoparium 　 　　　　　　　　　害虫刺伤后引起腐烂
Fusarium solani 　　　　褐色斑点
Guignardia psidii
（f．c．phyllosticta psidiicola） 　　　　　黑褐色腐烂
Macrophoma allabahadensis 　　　　　深绿色腐烂
Macrophomina spp. 　　　干腐烂
Mucor hiemalis 　 　　　　水状腐烂
Pestalodiopsis psidii 　　　　　　　　　　　　　　　表皮上出现破碎的褐绣色环状小斑点
Phoma psidii 　 　　　　　顶端褐色腐烂
Phomopsis destructum
Phytophthora nicotianae var parasitica 　　　褐色腐烂
Rhizopus stolonifer 　　　软腐烂
Thielaviopsis paradoxa 　　　软腐烂
细菌
Erwinia spp. 　　　 软腐烂
害虫
多种果蝇 　 　　　产卵